Gebruikers van softwarepakketten die voor het eerst gebruik willen maken van BAPI voor het doen van aangiften, kunnen BAPI-certificaten aanvragen bij DigiNotar. Ook de BAPI-postbussen kunnen weer bij de Belastingdienst worden aangevraagd.
Een aanvullende maatregel daarbij is, dat de ondernemer zich fysiek dient te identificeren bij 1 van de 16 sofi-afgiftepunten van de Belastingdienst. Hiervoor moet de gebruiker een afspraak maken met de BelastingTelefoon, 0800 – 0543.
Deze certificaten kunnen worden gebruikt tot het moment van uitgifte van nieuwe BAPI-certificaten door een andere leverancier. Gezien de aanvullende waarborgen bij het aanvragen in het BAPI-kanaal kan dit tijdelijk gebruik van deze certificaten op verantwoorde wijze plaatsvinden.